Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PolkQ9QUG2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PolkQ9QUG2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PolkQ9QUG2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PolkQ9QUG2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PolkQ9QUG2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PolkQ9QUG2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms