Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdgfl3Q9JMG7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms