Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cul3Q9JLV5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cul3Q9JLV5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms