Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
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Higd1aQ9JLR9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Higd1aQ9JLR9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1aQ9JLR9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1aQ9JLR9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1aQ9JLR9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1aQ9JLR9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1aQ9JLR9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1aQ9JLR9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Higd1aQ9JLR9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Higd1aQ9JLR9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1aQ9JLR9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Higd1aQ9JLR9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Higd1aQ9JLR9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Higd1aQ9JLR9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1aQ9JLR9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1aQ9JLR9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1aQ9JLR9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Higd1aQ9JLR9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Higd1aQ9JLR9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Higd1aQ9JLR9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Higd1aQ9JLR9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Higd1aQ9JLR9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Higd1aQ9JLR9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Higd1aQ9JLR9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Higd1aQ9JLR9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Higd1aQ9JLR9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Higd1aQ9JLR9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.9 ms