Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cabp2Q9JLK4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cabp2Q9JLK4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cabp2Q9JLK4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cabp2Q9JLK4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cabp2Q9JLK4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cabp2Q9JLK4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cabp2Q9JLK4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cabp2Q9JLK4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cabp2Q9JLK4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cabp2Q9JLK4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cabp2Q9JLK4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cabp2Q9JLK4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cabp2Q9JLK4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cabp2Q9JLK4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cabp2Q9JLK4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cabp2Q9JLK4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cabp2Q9JLK4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Cabp2Q9JLK4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cabp2Q9JLK4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms