Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bace2Q9JL18 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bace2Q9JL18 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms