Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL16

Isg20, Interferon-stimulated gene 20 kDa protein, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isg20Q9JL16 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Isg20Q9JL16 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Isg20Q9JL16 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Isg20Q9JL16 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms