Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Upk3aQ9JKX8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Upk3aQ9JKX8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Upk3aQ9JKX8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms