Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chrac1Q9JKP8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Chrac1Q9JKP8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms