Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nectin1Q9JKF6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nectin1Q9JKF6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nectin1Q9JKF6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nectin1Q9JKF6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nectin1Q9JKF6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nectin1Q9JKF6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nectin1Q9JKF6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nectin1Q9JKF6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms