Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scamp5Q9JKD3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scamp5Q9JKD3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms