Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
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Tuba8Q9JJZ2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Tuba8Q9JJZ2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Tuba8Q9JJZ2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tuba8Q9JJZ2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Tuba8Q9JJZ2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms