Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms