Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Caln1Q9JJG7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Caln1Q9JJG7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms