Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA2

Cog8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog8Q9JJA2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog8Q9JJA2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog8Q9JJA2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog8Q9JJA2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog8Q9JJA2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog8Q9JJA2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog8Q9JJA2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog8Q9JJA2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog8Q9JJA2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog8Q9JJA2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog8Q9JJA2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog8Q9JJA2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog8Q9JJA2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog8Q9JJA2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog8Q9JJA2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog8Q9JJA2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cog8Q9JJA2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cog8Q9JJA2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cog8Q9JJA2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cog8Q9JJA2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog8Q9JJA2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms