Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnip1Q9JJ57 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms