Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIK5

Ddx21, Nucleolar RNA helicase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx21Q9JIK5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ddx21Q9JIK5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx21Q9JIK5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddx21Q9JIK5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms