Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI91

Actn2, Alpha-actinin-2, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn2Q9JI91 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Actn2Q9JI91 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Actn2Q9JI91 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn2Q9JI91 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn2Q9JI91 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn2Q9JI91 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn2Q9JI91 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn2Q9JI91 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn2Q9JI91 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn2Q9JI91 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actn2Q9JI91 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn2Q9JI91 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn2Q9JI91 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn2Q9JI91 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actn2Q9JI91 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn2Q9JI91 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn2Q9JI91 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn2Q9JI91 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn2Q9JI91 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actn2Q9JI91 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn2Q9JI91 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn2Q9JI91 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Actn2Q9JI91 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actn2Q9JI91 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms