Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI9

Slc40a1, Solute carrier family 40 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc40a1Q9JHI9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc40a1Q9JHI9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc40a1Q9JHI9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc40a1Q9JHI9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc40a1Q9JHI9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc40a1Q9JHI9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc40a1Q9JHI9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc40a1Q9JHI9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc40a1Q9JHI9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc40a1Q9JHI9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc40a1Q9JHI9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc40a1Q9JHI9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc40a1Q9JHI9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc40a1Q9JHI9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms