Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc5a4aQ9ET37 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc5a4aQ9ET37 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc5a4aQ9ET37 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc5a4aQ9ET37 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc5a4aQ9ET37 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc5a4aQ9ET37 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc5a4aQ9ET37 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc5a4aQ9ET37 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc5a4aQ9ET37 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc5a4aQ9ET37 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc5a4aQ9ET37 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc5a4aQ9ET37 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc5a4aQ9ET37 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc5a4aQ9ET37 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc5a4aQ9ET37 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc5a4aQ9ET37 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc5a4aQ9ET37 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc5a4aQ9ET37 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc5a4aQ9ET37 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms