Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM6

Gdpd2, Glycerophosphoinositol inositolphosphodiesterase GDPD2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd2Q9ESM6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gdpd2Q9ESM6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gdpd2Q9ESM6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gdpd2Q9ESM6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gdpd2Q9ESM6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gdpd2Q9ESM6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gdpd2Q9ESM6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gdpd2Q9ESM6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gdpd2Q9ESM6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gdpd2Q9ESM6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gdpd2Q9ESM6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gdpd2Q9ESM6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gdpd2Q9ESM6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gdpd2Q9ESM6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gdpd2Q9ESM6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gdpd2Q9ESM6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gdpd2Q9ESM6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gdpd2Q9ESM6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gdpd2Q9ESM6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gdpd2Q9ESM6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gdpd2Q9ESM6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gdpd2Q9ESM6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gdpd2Q9ESM6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gdpd2Q9ESM6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gdpd2Q9ESM6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gdpd2Q9ESM6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gdpd2Q9ESM6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms