Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
Rb1cc1Q9ESK9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Rb1cc1Q9ESK9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Rb1cc1Q9ESK9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Rb1cc1Q9ESK9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Rb1cc1Q9ESK9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Rb1cc1Q9ESK9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
Rb1cc1Q9ESK9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Rb1cc1Q9ESK9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Rb1cc1Q9ESK9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Rb1cc1Q9ESK9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Rb1cc1Q9ESK9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Rb1cc1Q9ESK9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Rb1cc1Q9ESK9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Rb1cc1Q9ESK9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Rb1cc1Q9ESK9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Rb1cc1Q9ESK9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Rb1cc1Q9ESK9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Rb1cc1Q9ESK9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Rb1cc1Q9ESK9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Rb1cc1Q9ESK9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Rb1cc1Q9ESK9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Rb1cc1Q9ESK9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Rb1cc1Q9ESK9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Rb1cc1Q9ESK9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Rb1cc1Q9ESK9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
Rb1cc1Q9ESK9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
Rb1cc1Q9ESK9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Rb1cc1Q9ESK9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Rb1cc1Q9ESK9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Rb1cc1Q9ESK9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Rb1cc1Q9ESK9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
Rb1cc1Q9ESK9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Rb1cc1Q9ESK9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Rb1cc1Q9ESK9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Rb1cc1Q9ESK9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Rb1cc1Q9ESK9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Rb1cc1Q9ESK9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Rb1cc1Q9ESK9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Rb1cc1Q9ESK9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.94
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Rb1cc1Q9ESK9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms