Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc4Q9ES56 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc4Q9ES56 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc4Q9ES56 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc4Q9ES56 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc4Q9ES56 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc4Q9ES56 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc4Q9ES56 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc4Q9ES56 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc4Q9ES56 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc4Q9ES56 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc4Q9ES56 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc4Q9ES56 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc4Q9ES56 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc4Q9ES56 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc4Q9ES56 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc4Q9ES56 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc4Q9ES56 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms