Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ube3bQ9ES34 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ube3bQ9ES34 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms