Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim54Q9ERP3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim54Q9ERP3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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