Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chrnb2Q9ERK7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chrnb2Q9ERK7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms