Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms