Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ripk4Q9ERK0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ripk4Q9ERK0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ripk4Q9ERK0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms