Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tfip11Q9ERA6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tfip11Q9ERA6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tfip11Q9ERA6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tfip11Q9ERA6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tfip11Q9ERA6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tfip11Q9ERA6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tfip11Q9ERA6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tfip11Q9ERA6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tfip11Q9ERA6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tfip11Q9ERA6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tfip11Q9ERA6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tfip11Q9ERA6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tfip11Q9ERA6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tfip11Q9ERA6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tfip11Q9ERA6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tfip11Q9ERA6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tfip11Q9ERA6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tfip11Q9ERA6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tfip11Q9ERA6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tfip11Q9ERA6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tfip11Q9ERA6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tfip11Q9ERA6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tfip11Q9ERA6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tfip11Q9ERA6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tfip11Q9ERA6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms