Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW8

Ndst4, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst4Q9EQW8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndst4Q9EQW8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ndst4Q9EQW8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndst4Q9EQW8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms