Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ndst3Q9EQH7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ndst3Q9EQH7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Ndst3Q9EQH7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Ndst3Q9EQH7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Ndst3Q9EQH7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
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Ndst3Q9EQH7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Ndst3Q9EQH7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Ndst3Q9EQH7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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Ndst3Q9EQH7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ndst3Q9EQH7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms