Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r44Q9EQ47 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r44Q9EQ47 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r44Q9EQ47 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms