Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN1

Nudt12, Peroxisomal NADH pyrophosphatase NUDT12, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt12Q9DCN1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nudt12Q9DCN1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nudt12Q9DCN1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nudt12Q9DCN1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms