Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trmt112Q9DCG9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trmt112Q9DCG9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms