Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Swt1Q9DBQ9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Swt1Q9DBQ9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Swt1Q9DBQ9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms