Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cmtr1Q9DBC3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cmtr1Q9DBC3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms