Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf580Q9DB38 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf580Q9DB38 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf580Q9DB38 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf580Q9DB38 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf580Q9DB38 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf580Q9DB38 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf580Q9DB38 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf580Q9DB38 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf580Q9DB38 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf580Q9DB38 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf580Q9DB38 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf580Q9DB38 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf580Q9DB38 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf580Q9DB38 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf580Q9DB38 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Znf580Q9DB38 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Znf580Q9DB38 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Znf580Q9DB38 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf580Q9DB38 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Znf580Q9DB38 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms