Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Y7

1700025F22Rik, RIKEN cDNA 1700025F22, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700025F22RikQ9D9Y7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
1700025F22RikQ9D9Y7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700025F22RikQ9D9Y7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025F22RikQ9D9Y7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025F22RikQ9D9Y7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025F22RikQ9D9Y7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025F22RikQ9D9Y7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025F22RikQ9D9Y7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025F22RikQ9D9Y7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025F22RikQ9D9Y7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025F22RikQ9D9Y7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025F22RikQ9D9Y7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025F22RikQ9D9Y7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025F22RikQ9D9Y7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025F22RikQ9D9Y7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025F22RikQ9D9Y7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025F22RikQ9D9Y7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700025F22RikQ9D9Y7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700025F22RikQ9D9Y7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700025F22RikQ9D9Y7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700025F22RikQ9D9Y7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
1700025F22RikQ9D9Y7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms