Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N8

Pradc1, Protease-associated domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pradc1Q9D9N8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pradc1Q9D9N8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pradc1Q9D9N8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pradc1Q9D9N8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pradc1Q9D9N8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pradc1Q9D9N8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pradc1Q9D9N8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pradc1Q9D9N8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pradc1Q9D9N8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pradc1Q9D9N8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pradc1Q9D9N8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pradc1Q9D9N8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pradc1Q9D9N8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pradc1Q9D9N8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pradc1Q9D9N8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pradc1Q9D9N8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms