Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf138rt1Q9D9M9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf138rt1Q9D9M9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
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