Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmco5aQ9D9D5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmco5aQ9D9D5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmco5aQ9D9D5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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