Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Rexo2Q9D8S4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rexo2Q9D8S4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms