Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpap3Q9D706 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rpap3Q9D706 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpap3Q9D706 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpap3Q9D706 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms