Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nop56Q9D6Z1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nop56Q9D6Z1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop56Q9D6Z1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms