Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc94Q9D6J3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc94Q9D6J3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc94Q9D6J3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc94Q9D6J3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms