Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc39Q9D5Y1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc39Q9D5Y1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc39Q9D5Y1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc39Q9D5Y1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc39Q9D5Y1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc39Q9D5Y1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms