Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spsb1Q9D5L7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spsb1Q9D5L7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spsb1Q9D5L7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms