Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm3404Q9D506 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3404Q9D506 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3404Q9D506 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms