Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lonrf3Q9D4H7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lonrf3Q9D4H7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lonrf3Q9D4H7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms