Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Gcc1Q9D4H2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gcc1Q9D4H2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gcc1Q9D4H2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2230.4 ms