Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syce1Q9D495 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Syce1Q9D495 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms